太极阴阳图原称为“天地自然之图”，所以它应是自然界天地结构和运动原理的理论模型。
按照太极阴阳对立统一的基本法则，设对立统一关系的太阳为天，地球为地，即太阳和地球应具有太极阴阳图“阴阳互根”和“阴阳互用”的两大基本特征：太阳的内部主要可以分为三层：核心区、辐射区和对流区。太阳的核心区域虽然很小，半径只是太阳半径的四分之一，但却是太阳那巨大能量的真正源头。
太阳核心的温度极高，达一千五百万摄氏度，压力也极大，使得由氢聚变为氦的热核反应得以发生，从而释放出极大的能量。
这些能量再通过辐射层和对流层中物质的传递，才得以传送到达太阳光球的底部，并通过光球向外辐射到太阳的大气层。
换言之，太阳的核心区无疑是太阳巨大能量的物质基础，太阳没有这个由氢聚变为氦的热核反应的发生，亦即没有这个物质基础的转换，太阳就不会释放出巨大的能量。
太阳的核心区是物质基础属于阴，太阳的辐射区、对流区及太阳的大气层是其功能的体现属于阳。
任何一个事物都有其结构与功能两方面，体阴用阳，体在内，用在外，这两者是一个有机的整体，太阳也不例外。
阴阳是相对而言的，虽然太阳表面的温度是六千摄氏度，而其核心区温度更高，但从物质与功能这个角度来看，太阳核心区产生的热核反应为太阳表面的光辉提供了物质基础属于阴，其辐射区、对流区体现了功能属于阳，相对而言，二者是物质与功能、体与用的阴阳关系，是一个有机的整体。
以虚实言，虚为阳，实为阴，太阳的外围为虚为阳，太阳的核心区压力极大为实为阴。
再者，太阳的表面光芒万丈属于阳，而太阳的内部是不透明的，其内核深不可见属于阴。
所以从阴阳相对而言这个意义上来讲，这就是“阳中有阴”的结构格局，也就是所谓的“天本阳也，然阳中有阴”之道。
其核心区也极相似太极阴阳图“阳中有阴”的结构特征，即鱼眼。“阳得阴助而生化无穷”，显然，这一定是太阳内部的阴，外部的阴是不会使其生化无穷的。
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