命门大盛之阳气通过足太阳经的运行入十二脏之俞下降于五脏六腑，降者谓天，所以命门是人体内的天；五脏六腑之精气通过诸脉、宗脉皆上升于目睛命门上属于脑心，升者谓地，所以五脏是人体内的地。
命门足太阳经大盛之阳气下降于五脏六腑，五脏六腑门足太阳经下降于五脏六腑之俞，并唯肾而络，肾精主骨生髓直通于命门脑心，这就是“水能升而火能降，一升一降，无有穷已，故生意存焉”的天人相应观。
命门天之阳气与五脏地之阴气相互为用的升降运动将命门与五脏有机地联系在一起，使人体成为一个对立统一的之精气（
阴气）皆上升于目睛命门，这就是“气之升降，天地之更用也”的天人相应观。命整体，所以“人身小天地”“人是小乾坤”。
从整体看，命门阳中有阴，五脏阴中有阳就是太极阴阳图阴阳互根的结构模式；命门天之阳气下降于五脏，五脏地之阴气上升于命门就是太极阴阳图阴阳互用的运动模式。前者是结构，为体，后者是功能，为用，符合任何一个事物都有结构（体）与功能（用）的两个方面，也符合太极阴阳图的两大特征。
命门与五脏高下相召，升降相因，而生机不息，这就是《内经》的“天人合一”之道。
人们指出：“五脏之本，本之命门，神气之本，本在元精”。
五脏与命门是对立统一的天地阴阳关系，而阴以阳为主，地以天为主，所以“五脏之本，本在命门”，如同地球之本，本在太阳一样，没有太阳就没有地球。
命门元精化生元气，元气化生元神，所以命门元神元气之“神气之本，本在元精”，如同太阳的阳气神明之本，本在太阳的核心区一样，没有元精就没有神气。
可见人们早已精辟的阐述了命门与五脏的关系，只是没有上升到对立统一的天地阴阳关系。
人体受精卵的演变过程和规则与太极八卦的演变过程和规则是一样的，先人能以太极八卦的演变模式准确的预演出受精卵的演变过程，这是《内经》“天人相应”“天人一理”及“善言天者，必有验于人”的思想在人体中的验证，实属伟大！
仙人有神目，类似于猫科和犬科，其眼球的结构比较特殊。当光线透过视网膜到达在眼球后部的虹膜时，被虹膜再次反射到视网膜上成像，这就是在夜晚也能借助微光看得见的原因。
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